- La autopsia del 14 de noviembre de 2014, con muestra de la cavidad anal y perianal del bebé Alexander y el análisis del Instituto de Investigaciones Forenses (IDIF), no encontró Antígeno Prostático Específico (PSA) ni espermatozoides.
- El IDIF recolectó una frazada y papel higiénico del lugar del hecho, en ninguno de estos objetos encontró sangre, PSA ni tampoco espermatozoides.
- Tampoco se hallaron evidencias de PSA ni espermatozoides en los pañales del bebé recolectados del hospital Juan XXIII.
- Finalmente, un estudio genético concluyó que no se detectó ADN de Fernández.
Los jueces Patricia Pacajes, Roberto Mérida y Gladys Guerrero sentenciaron sobre lo siguiente:
- Informe médico forense que estableció supuesto desgarro anal.
- Declaración de al menos 60 testigos, de los cuales cuatro, que estaban en el lugar, ratificaron la inocencia de Fernández.
- Hallazgo de PSA (antígeno prostático específico) en el bebé, sin embargo, la Fiscalía no demostró que pertenece al médico y el IDIF no encontró nada.
- Hallazgo de PSA en el pañal del bebé, pero el Ministerio Público no demostró que corresponde al imputado y el IDIF sostuvo que no había PSA en ese objeto.